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La optimización de protocolos para la extracción de ADN de muestras fecales

La secuenciación de alto rendimiento ofrece nuevas posibilidades en ecología molecular y biología de la conservación. Sin embargo, el potencial de esta técnica no ha sido totalmente explotado para estudios no invasivos, a partir de muestras fecales, de fauna silvestre. La secuenciación de alto rendimiento permite la secuenciación de fragmentos de ADN cortos y podría permitir el genotipado simultáneo de un gran número de muestras y marcadores a un bajo coste. La aplicación de estas técnicas a muestras fecales de fauna silvestre ha sido obstaculizada por la gran cantidad de trabajo requerido en varios pasos, desde la recolección de muestras hasta la secuenciación. Se han evaluado protocolos alternativos que podrían permitir un mayor rendimiento en dos de estos pasos: muestreo de campo y extracción de ADN. En este trabajo se compararon dos métodos distintos de conservación de las muestras obtenidas en el campo y siete métodos de extracción de ADN para heces de lobos (Canis lupus). Se observó una gran variación en el éxito de genotipado según los protocolos que se sigan. El método de muestreo de campo basado en frotado superficial de los excrementos dio resultados peores que la recolección de un fragmento del excremento. Por otro lado, los protocolos para la extracción de ADN mostraban resultados muy variables y ofrecen mucho margen de optimización y mejora. La optimización de protocolos puede llevar a un monitoreo no invasivo mucho más eficiente, económico y con mayor rendimiento. La selección de marcadores apropiados sigue siendo de importancia vital para incrementar el éxito de genotipado. informacion[at]ebd.csic.es: Sarabia et al (2020) Towards high-throughput analyses of fecal samples from wildlife. Animal Biodiver Conserv 43.2: 271–283 Doi 10.32800/abc.2020.43.0271


http://abc.museucienciesjournals.cat/volum-43-2-2020/towards-high-throughput-analyses-of-fecal-samples-from-wildlife/?lang=en
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Identificadas 66 especies exóticas invasoras como las más perjudiciales para la biodiversidad en Europa

Identificadas 66 especies exóticas invasoras como las más perjudiciales para la biodiversidad en Europa

A partir de una lista de 329 especies exóticas capaces de poner en riesgo la biodiversidad, recientemente publicada por la UE, utilizando la metodología de evaluación temprana, se identificaron 8 especies como de muy alto riesgo para la biodiversidad en la región durante la próxima década, 40 de alto riesgo y 18 de riesgo intermedio. Este enfoque resulta novedoso por la escala continental abarcada, la amplitud de los grupos taxonómicos y ecosistemas considerados, y por la metodología y los datos utilizados. Se trata de plantas, invertebrados terrestres, especies marinas, invertebrados de agua dulce y vertebrados. La mayoría de las especies procede de Asia, Norte América y Sudamérica. Es más probable que las especies acuáticas lleguen a través de los barcos, mientras que los invertebrados terrestres lo harían con mayor frecuencia junto a mercancías, por ejemplo las plantas. Se pronostica que las regiones biogeográficas mediterráneas, continentales, macaronésicas y atlánticas serán las más amenazadas por todos los grupos taxonómicos, mientras que las regiones báltica, del mar Negro y boreal tienen menos riesgo. La región alpina parece no estar amenazada por ninguna especie. informacion[at]ebd.csic.es: Roy et al. (2018). Developing a list of invasive alien species likely to threaten biodiversity and ecosystems in the European Union. Glob Chang Biol DOI: 10.1111/gcb.14527


https://onlinelibrary.wiley.com/doi/full/10.1111/gcb.14527