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La optimización de protocolos para la extracción de ADN de muestras fecales

La secuenciación de alto rendimiento ofrece nuevas posibilidades en ecología molecular y biología de la conservación. Sin embargo, el potencial de esta técnica no ha sido totalmente explotado para estudios no invasivos, a partir de muestras fecales, de fauna silvestre. La secuenciación de alto rendimiento permite la secuenciación de fragmentos de ADN cortos y podría permitir el genotipado simultáneo de un gran número de muestras y marcadores a un bajo coste. La aplicación de estas técnicas a muestras fecales de fauna silvestre ha sido obstaculizada por la gran cantidad de trabajo requerido en varios pasos, desde la recolección de muestras hasta la secuenciación. Se han evaluado protocolos alternativos que podrían permitir un mayor rendimiento en dos de estos pasos: muestreo de campo y extracción de ADN. En este trabajo se compararon dos métodos distintos de conservación de las muestras obtenidas en el campo y siete métodos de extracción de ADN para heces de lobos (Canis lupus). Se observó una gran variación en el éxito de genotipado según los protocolos que se sigan. El método de muestreo de campo basado en frotado superficial de los excrementos dio resultados peores que la recolección de un fragmento del excremento. Por otro lado, los protocolos para la extracción de ADN mostraban resultados muy variables y ofrecen mucho margen de optimización y mejora. La optimización de protocolos puede llevar a un monitoreo no invasivo mucho más eficiente, económico y con mayor rendimiento. La selección de marcadores apropiados sigue siendo de importancia vital para incrementar el éxito de genotipado. informacion[at]ebd.csic.es: Sarabia et al (2020) Towards high-throughput analyses of fecal samples from wildlife. Animal Biodiver Conserv 43.2: 271–283 Doi 10.32800/abc.2020.43.0271


http://abc.museucienciesjournals.cat/volum-43-2-2020/towards-high-throughput-analyses-of-fecal-samples-from-wildlife/?lang=en
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La contaminación lumínica y el abandono del nido

La contaminación lumínica y el abandono del nido

Una de las fases más críticas en la vida de los petreles es el abandono del nido por parte de los pollos que pasan de la dependencia de los padres en la tierra a una vida independiente en el mar. Para mitigar la mortalidad en ese momento, cerca de las colonias de todo el mundo se llevan a cabo campañas de rescate, especialmente para pollos atraídos por la luz artificial. Se evalúa el plumaje y la condición corporal de pollos de pardela de Tasmania (Ardenna tenuirostris) capturados en las colonias antes de su abandono, en comparación con pollos orillados en las playas y pollos atraídos por la luz artificial a lo largo de las carreteras. Las aves orilladas tenían bajo peso y estaban en malas condiciones, lo que sugiere que sus probabilidades futuras de supervivencia en el mar son bajas. Las aves rescatadas en las carreteras como consecuencia de la atracción de luz tenían pesos e índices de condición inferiores que los pollos capturados en la colonia. Sin embargo, más del 50% de las aves atraídas por la luz alcanzaban pesos similares a los de los adultos, lo que sugiere que tienen mayores probabilidades de supervivencia que las aves orilladas. Mientras que ser orillado en las playas es un proceso natural, la iluminación a lo largo de las carreteras constituye una amenaza antropogénica cada vez mayor que requiere manejo. Por tanto, los esfuerzos de gestión y conservación deben estar dirigidos a proteger a las aves en las colonias y reducir la mortalidad inducida por la luz, idealmente a través de la reducción estratégica de las fuentes de luz. información: [at]ebd.csic.es: Rodriguez et al (2017) Light pollution and seabird fledglings: Targeting efforts in rescue programs. J Wild Manage doi:10.1002/jwmg.21237


http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/jwmg.21237/full