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La optimización de protocolos para la extracción de ADN de muestras fecales

La secuenciación de alto rendimiento ofrece nuevas posibilidades en ecología molecular y biología de la conservación. Sin embargo, el potencial de esta técnica no ha sido totalmente explotado para estudios no invasivos, a partir de muestras fecales, de fauna silvestre. La secuenciación de alto rendimiento permite la secuenciación de fragmentos de ADN cortos y podría permitir el genotipado simultáneo de un gran número de muestras y marcadores a un bajo coste. La aplicación de estas técnicas a muestras fecales de fauna silvestre ha sido obstaculizada por la gran cantidad de trabajo requerido en varios pasos, desde la recolección de muestras hasta la secuenciación. Se han evaluado protocolos alternativos que podrían permitir un mayor rendimiento en dos de estos pasos: muestreo de campo y extracción de ADN. En este trabajo se compararon dos métodos distintos de conservación de las muestras obtenidas en el campo y siete métodos de extracción de ADN para heces de lobos (Canis lupus). Se observó una gran variación en el éxito de genotipado según los protocolos que se sigan. El método de muestreo de campo basado en frotado superficial de los excrementos dio resultados peores que la recolección de un fragmento del excremento. Por otro lado, los protocolos para la extracción de ADN mostraban resultados muy variables y ofrecen mucho margen de optimización y mejora. La optimización de protocolos puede llevar a un monitoreo no invasivo mucho más eficiente, económico y con mayor rendimiento. La selección de marcadores apropiados sigue siendo de importancia vital para incrementar el éxito de genotipado. informacion[at]ebd.csic.es: Sarabia et al (2020) Towards high-throughput analyses of fecal samples from wildlife. Animal Biodiver Conserv 43.2: 271–283 Doi 10.32800/abc.2020.43.0271


http://abc.museucienciesjournals.cat/volum-43-2-2020/towards-high-throughput-analyses-of-fecal-samples-from-wildlife/?lang=en
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Una fuente de estrés oxidativo exógeno mejora el estatus oxidativo y favorece la síntesis de feomelanina en diamantes mandarines

Una fuente de estrés oxidativo exógeno mejora el estatus oxidativo y favorece la síntesis de feomelanina en diamantes mandarines

Algunos organismos pueden modular la expresión génica para obtener respuestas fisiológicas que ayudan a adaptarse al estrés ambiental. La síntesis del pigmento feomelanina en los melanocitos parece ser una de esas respuestas, ya que puede contribuir a la homeostasis celular. Se indujo experimentalmente estrés oxidativo en machos de diamante mandarín Taeniopygia guttata administrando el herbicida dibromuro de diquat durante el crecimiento de plumas para evaluar si la expresión de genes involucrados en la síntesis de feomelanina muestra labilidad epigenética. Debido a que la síntesis de feomelanina implica la disminución de la disponibilidad del principal antioxidante celular (glutatión), se espera que genere estrés oxidativo a menos que un mecanismo protector limite la síntesis de feomelanina y de esta forma favorezca la capacidad antioxidante. Sin embargo, la exposición a diquat no sólo mejoró la capacidad antioxidante de las aves, sino que además aumentó la expresión de un gen (AGRP) que promueve la síntesis de feomelanina en los melanocitos de las plumas, llevando al desarrollo de una coloración del plumaje más oscura. No se detectaron cambios en la expresión de otros genes involucrados en la síntesis de feomelanina (Slc7a11, Slc45a2, MC1R, ASIP and CTNS). Los niveles de metilación sólo cambiaron en MC1R, sugiriendo que modificaciones epigenéticas diferentes a cambios en metilación podrían regular la labilidad en la expresión de AGRP. Estos resultados sugieren que el estrés oxidativo exógeno indujo una respuesta hormética que mejoró el estatus oxidativo de las aves y, consecuentemente, promovió la pigmentación generada por feomelanina, apoyando la idea de que las aves ajustan la síntesis de feomelanina a sus condiciones de estrés oxidativo. información[at]ebd.csic.es: Rodríguez-Martínez & Galván (2019) A source of exogenous oxidative stress improves oxidative status and favors pheomelanin synthesis in zebra finches. Comp Biochem Phys C https://doi.org/10.1016/j.cbpc.2019.108667


https://www.sciencedirect.com/science/article/abs/pii/S1532045619303837