CGL2013-47547-P - Procesos micro y macro evolutivos en la

Durante los últimos años se ha incrementado mucho el conocimiento de la diversidad de anfibios en el Neotrópico. Mientras se describen especies nuevas cada año, otras muchas pasan a engrosar las listas de especies en peligro de extinción. Sin embargo, se sabe muy poco sobre los patrones y procesos que explican esta diversidad. En esta propuesta unimos esfuerzos de grupos de investigación de cuatro países (España, Suecia, Estados Unidos y Brasil) para estudiar el origen de la diversidad de anfibios, en el Neotrópico y en una especie Ibérica de la que se conoce muy bien su ecología, a diversas escalas espaciales y temporales, y mediante la utilización de métodos de análisis muy diferentes. En primer lugar, vamos a estudiar patrones macroevolutivos en la diversificación de los anfibios neotropicales. Vamos a investigar si las condiciones ecológicas imponen un límite a la diversificación de anfibios, tal y como lo sugiere el modelo ecológico de especiación, según el cual la disponibilidad de nichos ecológicos desocupados impone un límite en el número posible de especies de un linaje. Vamos a abordar esta cuestión mediante el análisis de la radiación de Eleuterodactylus en el Caribe. Este mismo grupo de especies permitirá investigar si la tasa de variación fenotípica y la tasa de diversificación están relacionadas, como se esperaría si la ecología fuera más importante que el aislamiento geográfico y la deriva genética en el proceso de diversificación (como en radiaciones adaptativas). Vamos a responder a estas preguntas mediante el uso de métodos tradicionales y de desarrollo reciente para los análisis comparativos integrando una filogenia calibrada con amplia información fenotípica y ecológico para todas las especies del grupo (alrededor de 190). En segundo lugar, vamos a utilizar enfoques genómicos para estudiar la historia demográfica y evolutiva del género Oreobates en ausencia de un genoma de referencia. Se trata de un género poco conocido de ranas neotropicales que incluye especies adaptadas a ambientes de tierras altas y tierras bajas. Vamos a ensamblar el transcriptoma de una de las especies para utilizarlo como referencia. Para las otras especies generaremos secuencias de todo el genoma y las lecturas se van a proyectar contra el transcriptoma de referencia para identificar polimorfismos. Con esta información vamos a investigar las relaciones filogenéticas entre las especies, vamos a estudiar cambios demográficos a través del tiempo y su correspondencia con cambios en el hábitat, y vamos a identificar las partes del genoma más diferenciadas entre poblaciones con diferente grado de aislamiento y que podría indicar un proceso incipiente de especiación. Por último, vamos a utilizar un panel de microsatélites y un gran número de marcadores SNP (obtenido utilizando métodos de “genotyping-by-sequencing”) para investigar los cambios en la modularidad y la diferenciación de las poblaciones de sapo partero bético (Alytes dickhilleni) como consecuencia de las diferencias en la estructura del hábitat. Este estudio permitirá ver si la utilización de técnicas genómicas con un puñado de individuos es suficientemente robusta como para detectar la estructura de población en pequeñas escalas espaciales y temporales de modo que en estudios futuros se podría reducir el impacto sobre las poblaciones naturales.