La Ley del Parque Nacional de Doñana de 1978 asigna al director de la Estación Biológica de Doñana la “coordinación de todos los programas de investigación que se lleven a cabo en el parque nacional” de Doñana. Para apoyar esta labor en 1989 se crea la Oficina de Coordinación de la Investigación.
Las funciones actuales son la tramitación, coordinación y seguimiento de los proyectos de investigación en Doñana, el mantenimiento de bases de datos institucionales y la elaboración de informes anuales. Se centralizan las actividades de divulgación y comunicación, gestión de personal externo y de la prevención de riesgos laborales. Se colabora en la organización de eventos tanto divulgativos como científicas. Por último, se apoya la gestión de proyectos internacionales y, de modo general, la de los proyectos de alcance institucional.