Aunque el CSIC no cuenta con una escuela de doctorado ni tiene capacidad para impartir titulaciones universitarias, sí pueden ser dirigidas por personal investigador de los centros.
Cada año, entre 10 y 15 investigadores predoctorales defienden sus tesis desarrolladas en la Estación Biológica de Doñana. Existen becas a nivel estatal (FPU y FPI) para el desarrollo de tesis doctorales así como becas asociadas a proyectos de investigación.