En el Laboratorio de Ecología Molecular (LEM) facilita el desarrollo de proyectos de investigación que incluyen técnicas genéticas y apoya al personal científico de la infraestructura, equipamiento y asesoramiento técnico necesarios. Actualmente, el LEM está inmerso en un proceso de fortalecimiento de las capacidades genómicas.
El LEM da soporte a una parte notable de los proyectos de investigación de la Estación Biológica de Doñana, con una gran proporción del personal investigador involucrado. El laboratorio pretende ser flexible y adaptarse a los nuevos protocolos y publicaciones que se desarrollan dentro del campo de la ecología y la genética, actualizando la metodología, el software y el asesoramiento.